Mark Webber ilk yarışına 1997'de kendi seyircisi önünde Melbourn Albert Parkta çıktı.Yakın tarihte kendi seyircisi önünde yarışa çıkan ilk pilottur.1996 da Formula Braham kategorisinde yarışırken Melbourne de kazandı.

1995 te ingiltere de düzenlenen uluslararası formula ford festivali yarışını 3. bitirerek uluslararası düzeyde bir çıkış yakaladı.Webber Ayrton Senna nın ve Eddie Irvine'nınde yarışmış olduğu ünlü Van Diemen Formula Ford takımıyla 1996 da İngiltere de yarışmak için anlaştı.ve bu seride 1996 da şampiyon oldu.

Bu başarının devamında 1997 de İngiltere formula 3 şampiyonasında yarıştı.Ekonomik açıdan zorlanmalarına ve finansal kaynakların tükenmesiyle neredeyse sezonun ortasında bırakacak olmalarına rağmen bu seriyi 4. sırada bitirdi.Bu sezon göstermiş olduğu performanslardan etkilenen Mercedes patronu 1998 sezonu için onun Mercedes AMG Sports takımına test pilotu olarak gelmesi için teklif etti.

Test büyük başarıydı ve Webber 1998 sezonu için FIA GT şampiyonasında eski F1 pilotu Bernd Schneider ile birlikte yarışmak için imza attı.Mercedes rehberliği altında Webber çabucak olgunlaştı ve daha 20 yaşındayken büyük bir takımla yarış ortamlarına girmişti.

1998 sezonu büyük test programları ve Amerika'da Japonya'da Avrupa'da katıldığı 10 turluk yarışlarla unutulmaz bir sezondu.Webber/Schneider ikilisi 5 yarış birinciliği kazandı ama takım arkadaşları Klaus Ludwig ve Ricardo Zonta tarafından şampiyonada birinciliği kaçırdılar.1999da Webber kendi arabasında yarışmaya başladı ancak araba yarışlarına olan sevdası
yaşamış olduğu iki büyük yüksek süratli hızlı kaza ile birlikte biranda noktalandı.Mercedes'te bulunan açık aerodynamik hatası Webberin aracının takla atmasına sebep oldu.

Webber gelecek sezon için tek koltuklu araçlarla yarışmada karalıydı.Paul Stoddart'ın yeni European Formula Racing takımıyla uluslararası formula 3000 de yarışmak için çalışmalara başladı.

2000de Foster Webberin Formula 3000de yarışması için sponsor oldu.2.yarış Silverstone da beklenmedik birincilik kazandı.Sezonu iki tane 3 senelik deneyimi bulunan pilotların arkasında 3. sırada bitirdi.Bu çaylak birisi için çok büyük bir başarıydı.

Bu sonuç Benetton Playlife takımının ilgisini onun üzerine çekti.Eylül 2000de Portekiz'de 3 günlük test programına katıldı ve başarılı oldu.Takım Webber ile uzun süreli anlaşma imzaladı.2001 sezonunda Benetton tarafından Super Nova takımı ile Formula 3000de yarışması anlaşması yapıldı.Ayrıca Benetton F1 takımının resmi test pilotu olmuştu.

2001 de Webber İmola Monaco ve Magny Coursta birinci oldu.sezonu klasmanda 2. sırada bitirdi.Benetton Renault F1 takımı ile yoğun test programlarına katıldı ve sezon sonunda artan performansa katkıda bulundu.2002de Minardi takımına katıldı.Kendi seyircisi önünde pistlere çıkmasıyla PS02sini 5.sırada bitirmeyi sağladı ve 2 puan aldı.Bu sonuçla beraber kalabalık çılgına dönmüştü.Bu an onun şüphesiz unutamayacağı anlardan birisiydi.

2002de bu 2 puandan başka puan alamadı.Ama Monaco da müthiş yarış çıkardı ve Jaguar takım patronunun bunu fark etmesiyle 2003 sezonu için Jaguar da Antonio Pizzonia nın takım arkadaşı oldu.Jaguar da iyi bir sezon geçirdi.17 puan alarak sezonu 10. sırada bitirdi.Bu yükseliş büyük takımların dikkatini çekmişti ama onun Jaguarda hala 1 sezonluk anlaşması vardı.

2003 te ki parlak sezonlarına rağmen 2004 senesi hem Webber hemde Jaguar için iyi bir şekilde geçmedi.Takım sezonun ortasında satılacağını açıkladı.Tüm zorluklara rağmen bazen özellikle sıralama turlarında Webber büyük başarılar ve parlamalar gösterdi.Malezya Gpsinde sıralamalarda Michael Schumacher'in yanında güçlü bir şekilde 2.liği kazandı.ama sezon genel anlamda çonlar için çok kötüydü.

Frank Williams'ın bazı zamanlarda Webberin üzerinde gözü vardı.Bunun sonucunda 2005 te Heidfeldin takım arkadaşlığın Webberi getirdi.Ancak bekleneni sağlayamayan BMW ve Webber kötü bir sezon geçirdi.Takım arkadaşı ondan daha iy bir sezon geçirdi.Webber tek bir defa podyuma çıkmayı başardı.36 puan alarak sezonu 10. sırada bitirdi.

Webber 2006da Williams ile devam etti ve ona takımda çaylak pilot Nico Rosberg eşlik etti.Webber genelde sezon boyunca Rosbergin önünde yer almayı başardı ancak 2006 tamamı ile Williamsın kötü bir sezonu oldu.Webber sezon ortasında Red Bull takımına geçeceğini duyurdu.Webber sezonu 14. sırada tamamladı.

2007 yılında Red Bull adına yarışan Webber takım arkadaşı Coulthard'a oranla biraz daha geride kaldı. Ancak Avustralyalı pilot yağmurlu Avrupa yarışında Red Bull'u ile podyuma çıkmayı başardı. Webebr sezonu 10. puanla 12. sırada tamamladı.